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Se empleó un enfoque RMN-computacional combinada para determinar la estructura de la solución de la (-) - trans-anti-aducto [BP] dG posicionado frente a un -1 sitio de deleción en el d (C1-C2-A3-T4-C5- [ BP] G6-C7-T8-A9-C10-C11) .d (G12-G13-T14-A15-G1 6-G17-A18-T19-G20-G21) secuencia de contexto. El (-) - trans-anti- resto [BP] dG se deriva de la unión de la (-) - anti-benzo [a] pireno diol epóxido [(-) - anti-BPDE] para N2 de DG6 y tiene una 10R configuración absoluta en el sitio de la vinculación [BP] dG. Fueron asignados Los intercambiables y no intercambiables protones del benzo [a] resto pirenilo y el ácido nucleico tras el análisis de conjuntos de dos dimensiones de datos de RMN en solución H2O y D2O. La conformación solución ha sido determinado por la incorporación de las distancias entre protones intramoleculares e intermoleculares definidas por límites inferior y superior deducidas de NOESY espectros como medios de coerción en la mecánica cálculos moleculares en el espacio ángulo de torsión seguidos por sobrias cálculos de dinámica molecular basado en la distancia y el refinamiento intensidad protocolo NOE . Nuestros estudios estructurales establecen que los aromáticos BP se intercala del sistema de anillo en la hélice opuesta al sitio de eliminación, mientras que el residuo desoxiguanosina modificado se desplaza en el surco menor con su cara paralela al eje de la hélice. El sitio de intercalación es en forma de cuña y el sistema de anillo aromático BP pilas sobre intactos que flanquean pares de bases de Watson-Crick dG.dC. Las pilas desoxiguanosina modificados sobre la faz surco menor del anillo de azúcar del residuo DC5 5'-acompañamiento. El resto de BP se posiciona con el anillo bencílico orientada hacia el surco menor y el anillo aromático pirenilo distal dirigido hacia el surco mayor. Esta conformación contrasta notablemente con la estructura correspondiente en el dúplex completo con el mismo 10R (-) - trans-anti-lesión [BP] dG posicionado frente a un residuo dC complementarios [de los Santos et al. (1992) Biochemistry 31, 5.245-5.252); en este caso el sistema de anillo aromático BP se encuentra en el surco menor, y no hay interrupción de la [BP] dG.dC Watson-Crick alineación apareamiento de bases. Las características de desplazamiento de intercalación-base de la 10R (-) - trans-anti-aducto [BP] dG enfrente de un sitio de deleción tienen características en común con las de los 10S (+) - trans-anti-aducto [BP] dG frente a una sitio de deleción informó previamente por Cosman et al. [(1994) (Biochemistry 33, 11507 a 11517], excepto que hay una rotación de casi 180 grados del residuo BP alrededor del eje de la hélice en el sitio de la intercalación de base desplazada y la desoxiguanosina modificado se coloca en la ranura opuesta. . En el aducto 10S, el anillo bencílico es en el surco mayor y los sistemas de anillos aromáticos apuntan hacia el surco menor Este trabajo se extiende el tema de orientaciones opuestas de aductos derivados de pares quirales de (+) - y (-) - anti- enantiómeros BPDE; ambos 10S y aductos 10R pueden ser posicionados con orientaciones opuestas, ya sea en el surco menor o en sitios de intercalación de base desplazados, dependiendo de la presencia o ausencia de la base dC socio en la cadena complementaria.  

 

 

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