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El elemento UP, un componente de promotores bacterianos situados aguas arriba de la hexámero -35, aumenta la transcripción mediante la interacción con la ARN polimerasa de la subunidad alfa. Mediante el uso de una modificación del procedimiento SELEX para la identificación de sitios de unión a proteínas, se seleccionaron in vitro y posteriormente se exhibió en vivo para las secuencias que aumentaron enormemente la actividad promotora cuando situada aguas arriba del núcleo promotor Escherichia coli rrnB P1. Un conjunto de 31 de estas secuencias aguas arriba aumento de la transcripción de 136- a 326 veces en vivo, considerablemente más que el elemento rrnB P1 UP natural, y se utilizó para derivar una secuencia de consenso: -59 nnAAA (A / T) (A / T) T (A / T) TTTTnnAAAAnnn -38. La secuencia seleccionada más activo contenía el consenso derivada, muestra todas las propiedades de un elemento UP, y la interacción de esta secuencia con el dominio alfa C-terminal fue similar a la de los elementos previamente caracterizados UP. La identificación de la UP elemento de consenso debe facilitar una comprensión detallada de la interacción ADN-alfa. Sobre la base de la conservación evolutiva de los residuos en alfa responsable de la interacción con los elementos UP, se sugiere que la secuencia de consenso elemento UP debe ser aplicable en todo eubacterias, en general, debe facilitar la predicción promotor, y puede ser de utilidad para aplicaciones biotecnológicas.  

 

 

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