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OBJETIVOS: El desarrollo de un fluorogénica, 5 'nucleasa, ensayo TaqMan PCR para la detección de Ri-plásmidos de alfombra de raíces inducir Agrobacterium biovar 1 strains.METHODS Y RESULTADOS: Una sonda TaqMan y conjunto de cebadores fueron diseñados dentro de la secuencia de ADN-T de una alfombra de raíces conocido inducir cepa de Agrobacterium. Ciento diez Agrobacterium y bacterias estrechamente relacionadas se sometieron a pruebas de esta novela PCR y comparación con los resultados de una PCR convencional que detecta Ti y Ri-plásmidos. Los medios de comunicación selectiva Agrobacterium, Medium 1A se modificó en forma de caldo para su uso como un enriquecimiento del patógeno a partir de muestras antes de las PCR.CONCLUSIONS TaqMan: El patógeno capa de raíces se detectó con éxito de una gama de tipos de muestras usando el ensayo de PCR fluorogénico enriquecido, negando la necesidad de procedimientos de extracción de ADN complejas y técnicas de procesamiento post-PCR tales como electroforesis en gel. Por tanto, la técnica es una method.SIGNIFICANCE detección rápida y rentable E IMPACTO DEL ESTUDIO: Este es el primer reporte conocido de una fluorogénica, 5 'nucleasa, ensayo TaqMan diseñado para detectar un patógeno vegetal Agrobacterium. El método puede ser usado como un sistema modelo para la detección de otros patógenos Agrobacterium.  

 

 

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